No llegaron a la fase de grupos de la Champions 2011-12, tras acumular derrotas ante el APOEL y el Zenit San Petersburgo, los eventuales ganadores de grupo y subcampeones. Con estos resultados, terminó esta fase como primera de grupo. En su tercer y último partido en la fase de grupos, frente a Grecia, venció por 1-2 con goles de Rubén de la Red y de Dani Güiza, remontando el tanto inicial de Angelos Charisteas.
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